Changeset 1446


Ignore:
Timestamp:
03/22/14 19:31:49 (11 years ago)
Author:
rkrimmel
Message:

Changed default sequences name to "sequences"

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/autoquest-plugin-alignment/src/main/java/de/ugoe/cs/autoquest/plugin/alignment/commands/CMDbinaryAlignment.java

    r1330 r1446  
    4545         */ 
    4646        public void run(List<Object> parameters) { 
    47                 String sequencesName; 
     47                String sequencesName = "sequences"; 
    4848                String algorithm; 
    4949                try { 
     
    7171                                        SimpleSequenceGenerator gen = new SimpleSequenceGenerator(); 
    7272                                        gen.generate(sequences); 
    73                                         int[] seq1 = gen.get(0); 
    74                                         int[] seq2 = gen.get(0); 
     73                                        int[] seq1 = gen.get(0).getSequence(); 
     74                                        int[] seq2 = gen.get(0).getSequence(); 
    7575                                        ObjectDistanceSubstitionMatrix submat = new ObjectDistanceSubstitionMatrix(); 
    7676                                        submat.generate(sequences); 
     
    8080                                sw.printDPMatrix(); 
    8181                                System.out.println(); 
    82                                 //sw.printAlignments(); 
     82                                sw.printAlignments(); 
    8383                                // sw.getMatches(); 
    8484                                } 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.