Changeset 1664


Ignore:
Timestamp:
08/12/14 21:38:00 (10 years ago)
Author:
rkrimmel
Message:

Finally i can replace.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/autoquest-core-tasktrees-alignment/src/main/java/de/ugoe/cs/autoquest/tasktrees/temporalrelation/SequenceForTaskDetectionRuleAlignment.java

    r1662 r1664  
    203203                                                        .hasNext();) { 
    204204                                                int start = jt.next(); 
    205                                                 // TODO: Debug Output 
    206                                                 /* 
    207                                                  * System.out.println("Found match "); 
    208                                                  * pattern.getFirstSequence().printSequence(); 
    209                                                  * pattern.getSecondSequence().printSequence(); 
    210                                                  * System.out.println("in sequence " + (j+1) + 
    211                                                  * " at position " + start); for(int 
    212                                                  * k=0;k<tempns.getSequence().length;k++) { 
    213                                                  * System.out.print(k + ": " + tempns.getSequence()[k] + 
    214                                                  * " "); 
    215                                                  * System.out.println(appData.getNumber2Task().get( 
    216                                                  * tempns.getSequence()[k])); } 
    217                                                  */ 
    218205                                                pattern.addOccurence(new MatchOccurence(start, start 
    219206                                                                + pattern.size(), j)); 
     
    255242                                                        + (oc.getStartindex()) 
    256243                                                        + "-" 
    257                                                         + (oc.getStartindex() + matchseqs.get(i) 
    258                                                                         .getFirstSequence().size())); 
     244                                                        + oc.getEndindex()); 
    259245                                        System.out.println(); 
    260246 
     
    265251                                        } 
    266252 
     253                                        // Check if nothing has been replaced in the sequence we 
     254                                        // want to replace 
     255                                        if (replacedOccurences.get(oc.getSequenceId()) == null) { 
     256                                                replacedOccurences.put(oc.getSequenceId(), 
     257                                                                new LinkedList<MatchOccurence>()); 
     258                                        } else { 
     259                                                // check if we have any replaced occurence with indexes 
     260                                                // smaller than ours. If so, we need to adjust our start 
     261                                                // and endpoints 
     262                                                // of the replacement. 
     263                                                // Also do a check if we have replaced this specific 
     264                                                // MatchOccurence in this sequence already. Jump to the 
     265                                                // next occurence if this is the case. 
     266                                                // This is no more neccessary once the matches are 
     267                                                // harmonized. 
     268                                                for (Iterator<MatchOccurence> jt = replacedOccurences 
     269                                                                .get(oc.getSequenceId()).iterator(); jt 
     270                                                                .hasNext();) { 
     271                                                        MatchOccurence tmpOC = jt.next(); 
     272                                                         
     273                                                        if (oc.getStartindex() >= tmpOC.getStartindex() && oc.getStartindex()<=tmpOC.getEndindex()) { 
     274                                                                System.out.println("This position has already been replaced in this iteration"); 
     275                                                                continue invalidOccurence; 
     276                                                        } 
     277                                                        if (oc.getEndindex()>=tmpOC.getStartindex()) { 
     278                                                                continue invalidOccurence; 
     279                                                                 
     280                                                        } 
     281                                                        else if (oc.getStartindex()>tmpOC.getEndindex()) { 
     282                                                                int diff = tmpOC.getEndindex() 
     283                                                                                - tmpOC.getStartindex(); 
     284                                                                // Just to be sure. 
     285                                                                if (diff > 0) { 
     286                                                                        System.out.println("Old index: Start: " 
     287                                                                                        + oc.getStartindex() + " End " 
     288                                                                                        + oc.getEndindex()); 
     289                                                                        oc.setStartindex(oc.getStartindex() - diff+1); 
     290                                                                        oc.setEndindex(oc.getEndindex() - diff+1); 
     291                                                                        System.out.println("Updated index: Start: " 
     292                                                                                        + oc.getStartindex() + " End " 
     293                                                                                        + oc.getEndindex()); 
     294                                                                } else { 
     295                                                                        Console.traceln(Level.WARNING, 
     296                                                                                        "End index of a Match before start. This should never happen"); 
     297                                                                } 
     298                                                        } 
     299                                                } 
     300                                        } 
    267301                                        ISequenceInstance sequenceInstances = RuleUtils 
    268302                                                        .createNewSubSequenceInRange( 
     
    275309                                                        + sequenceInstances.size() 
    276310                                                        - RuleUtils.missedOptionals); 
    277  
    278                                         updateMatchIndexes(matchseqs, oc.getSequenceId(), 
    279                                                         oc.getStartindex(), oc.getEndindex()); 
    280  
     311                                        replacedOccurences.get(oc.getSequenceId()).add(oc); 
    281312                                } 
    282313                        } 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.