Changeset 1707 for trunk


Ignore:
Timestamp:
09/01/14 19:03:47 (10 years ago)
Author:
rkrimmel
Message:

Possibility to save intermediate results

Location:
trunk
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/autoquest-ui-core-alignment/src/main/java/de/ugoe/cs/autoquest/commands/usability/CMDgenerateTaskTree.java

    r1146 r1707  
    2828/** 
    2929 * <p> 
    30  * This command generates a task tree based on the provided sequences. It uses the 
    31  * {@link TaskTreeManager} for this purpose. Please consult the documentation of the task tree 
    32  * manager for more details. 
     30 * This command generates a task tree based on the provided sequences. It uses 
     31 * the {@link TaskTreeManager} for this purpose. Please consult the 
     32 * documentation of the task tree manager for more details. 
    3333 * </p> 
    3434 *  
     
    3838public class CMDgenerateTaskTree implements Command { 
    3939 
    40     /* 
    41     * (non-Javadoc) 
    42     *  
    43     * @see de.ugoe.cs.util.console.Command#help() 
    44     */ 
    45     @Override 
    46     public String help() { 
    47         return "generateTaskTree <sequences> {<tasktree>}"; 
    48     } 
     40        /* 
     41        * (non-Javadoc) 
     42        *  
     43        * @see de.ugoe.cs.util.console.Command#help() 
     44        */ 
     45        @Override 
     46        public String help() { 
     47                return "generateTaskTree <sequences> {<tasktree>} {<boolean: harmonize sequences or not (true or false)>} {<integer: number of threads>}"; 
     48        } 
    4949 
    50     /* 
    51      * (non-Javadoc) 
    52      *  
    53      * @see de.ugoe.cs.util.console.Command#run(java.util.List) 
    54      */ 
    55     @SuppressWarnings("unchecked") 
    56     @Override 
    57     public void run(List<Object> parameters) { 
    58         String sequencesName; 
    59         String tasktreeName; 
    60         try { 
    61             sequencesName = (String) parameters.get(0); 
    62             if (parameters.size() > 1) { 
    63                 tasktreeName = (String) parameters.get(1); 
    64             } 
    65             else { 
    66                 tasktreeName = "tasktree"; 
    67             } 
    68         } 
    69         catch (Exception e) { 
    70             throw new IllegalArgumentException("must provide a sequences name"); 
    71         } 
     50        /* 
     51         * (non-Javadoc) 
     52         *  
     53         * @see de.ugoe.cs.util.console.Command#run(java.util.List) 
     54         */ 
     55        @SuppressWarnings("unchecked") 
     56        @Override 
     57        public void run(List<Object> parameters) { 
     58                String sequencesName; 
     59                String tasktreeName; 
     60                try { 
     61                        sequencesName = (String) parameters.get(0); 
     62                        if (parameters.size() > 1) { 
     63                                tasktreeName = (String) parameters.get(1); 
     64                        } else { 
     65                                tasktreeName = "tasktree"; 
     66                        } 
     67                } catch (Exception e) { 
     68                        throw new IllegalArgumentException("must provide a sequences name"); 
     69                } 
     70                if (parameters.size() > 2) { 
     71                        String harmonize = (String) parameters.get(2); 
     72                        de.ugoe.cs.autoquest.tasktrees.temporalrelation.SequenceForTaskDetectionRuleAlignment.harmonizeSequences = true; 
     73                        System.out.println(harmonize); 
     74                        if (harmonize.equals("false")) { 
     75                                System.out.println("Not harmonizing"); 
     76                                de.ugoe.cs.autoquest.tasktrees.temporalrelation.SequenceForTaskDetectionRuleAlignment.harmonizeSequences = false; 
     77                        } 
     78                } 
     79                if (parameters.size() > 3) { 
     80                        String threadCount = (String) parameters.get(3); 
     81                        de.ugoe.cs.autoquest.tasktrees.temporalrelation.SequenceForTaskDetectionRuleAlignment.nThreads = 1; 
     82                        try { 
     83                                int tmp = Integer.parseInt(threadCount); 
     84                                de.ugoe.cs.autoquest.tasktrees.temporalrelation.SequenceForTaskDetectionRuleAlignment.nThreads = tmp; 
     85                        } catch (Exception e) { 
     86                                throw new IllegalArgumentException( 
     87                                                "The fourth parameter must be an integer. Did you forget to name the tasktree?"); 
     88                        } 
     89                } 
    7290 
    73         Collection<List<Event>> sequences = null; 
    74         Object dataObject = GlobalDataContainer.getInstance().getData(sequencesName); 
    75         if (dataObject == null) { 
    76             CommandHelpers.objectNotFoundMessage(sequencesName); 
    77             return; 
    78         } 
    79         if (!SequenceInstanceOf.isCollectionOfSequences(dataObject)) { 
    80             CommandHelpers.objectNotType(sequencesName, "Collection<List<Event<?>>>"); 
    81             return; 
    82         } 
     91                Collection<List<Event>> sequences = null; 
     92                Object dataObject = GlobalDataContainer.getInstance().getData( 
     93                                sequencesName); 
     94                if (dataObject == null) { 
     95                        CommandHelpers.objectNotFoundMessage(sequencesName); 
     96                        return; 
     97                } 
     98                if (!SequenceInstanceOf.isCollectionOfSequences(dataObject)) { 
     99                        CommandHelpers.objectNotType(sequencesName, 
     100                                        "Collection<List<Event<?>>>"); 
     101                        return; 
     102                } 
    83103 
    84         sequences = (Collection<List<Event>>) dataObject; 
    85          
    86         ITaskModel taskModel = new TaskTreeManager().createTaskModel(sequences); 
    87          
    88         if (GlobalDataContainer.getInstance().addData(tasktreeName, taskModel)) { 
    89             CommandHelpers.dataOverwritten(sequencesName); 
    90         } 
    91          
    92     } 
     104                sequences = (Collection<List<Event>>) dataObject; 
     105 
     106                ITaskModel taskModel = new TaskTreeManager().createTaskModel(sequences); 
     107 
     108                if (GlobalDataContainer.getInstance().addData(tasktreeName, taskModel)) { 
     109                        CommandHelpers.dataOverwritten(sequencesName); 
     110                } 
     111 
     112        } 
    93113 
    94114} 
  • trunk/java-utils-alignment/src/main/java/de/ugoe/cs/util/StopWatch.java

    r1128 r1707  
    1616 
    1717import java.io.PrintStream; 
     18import java.io.Serializable; 
    1819import java.text.DecimalFormat; 
    1920import java.util.HashMap; 
     
    3435 * @author Patrick Harms 
    3536 */ 
    36 public class StopWatch { 
    37      
    38     /** 
     37public class StopWatch implements Serializable{ 
     38     
     39    /** 
     40         *  
     41         */ 
     42        private static final long serialVersionUID = -4216393284789336830L; 
     43        /** 
    3944     * the splits hold internally 
    4045     */ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.