Changeset 1581


Ignore:
Timestamp:
06/26/14 23:18:23 (11 years ago)
Author:
rkrimmel
Message:

Fixed check if traceback is too long.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • branches/ralph/src/main/java/de/ugoe/cs/autoquest/tasktrees/alignment/algorithms/SmithWatermanRepeated.java

    r1578 r1581  
    227227                        if(count != 0) 
    228228                        { 
     229                                if (length1+length2+2 == count) {        
     230                                        Console.traceln(Level.WARNING, "Traceback longer than both sequences summed up!"); 
     231                                        break; 
     232                                } 
    229233                                aligned1[count] = tmp.getXvalue(); 
    230234                                aligned2[count] = tmp.getYvalue(); 
     
    233237                        tmp = tmp.getPrevious(); 
    234238                        count++; 
    235                 if (length1+length2+2 == count) {        
    236                         Console.traceln(Level.WARNING, "Traceback longer than both sequences summed up!"); 
    237                         break; 
    238                 } 
    239                          
     239                 
    240240                } while(tmp != null); 
    241241                count--; 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.